Somos una organización solidamente estructurada, participativa, democrática e incluyente, con equidad de género, compuesta por los siguientes órganos de base:

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 1. Congreso Cafetalero:  Máxima Autoridad de la Organización, que se celebra entre los meses de octubre a diciembre de cada año, con la participación de 210 presidentes de Juntas Locales, 50 presidentes de Cooperativas Cafetaleras afiliadas y 15 representantes de Juntas Departamentales, previamente convocados por la Junta Directiva Nacional, quienes representan a los 120,000 productores y productoras afiliados a la Organización.

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2. Junta Directiva Nacional: Lo conforman 15 representantes de las Juntas Departamentales y representan legalmente a la Organización Nacional e Internacionalmente.

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​3. Juntas Departamentales:  Organizadas en 15 de los 18 departamentos que conforman el territorio nacional y son integradas por los presidentes de Juntas Locales y Cooperativas Cafetaleras.

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4. Juntas Locales: Organizadas en 210 de los 298 municipios de Honduras, integradas por los presidentes de las Juntas Rurales.

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5. Cooperativas Cafetaleras:  50 Cooperativas Cafetaleras legalmente reconocidas por el Consejo Nacional Supervisor de Cooperativas CONSUCOOP y afiliadas AHPROCAFE.